通过反向对接的方法筛选triclosan新靶标的研究

摘要：本文通过运用DiscoveryStudio中的CDOCKER方法，将triclosan寻找226个受体蛋白中的对接triclosan最终找到了潜在的目标Receptor-interacting protein 1 (RIP1), Apoptosis signal-regulating，kinase 1 (ASK1) and B-cell lymphoma 2 (Bcl-2)三种受体蛋白和triclosan对接打分别为-26.88, -23.34，-22.96 kcal/mol。可以作为triclosan然后研究靶蛋白triclosan引起人体疾病的机制。

分子对接（molecular docking）它是基于结构药物设计的核心模拟手段，根据受体与配体的几何匹配和能量匹配过程，预测两者之间最好的组合模式和亲和力。利用分子对接模拟技术，研究人员可以进行药物虚拟筛选、药物分子结构改造、药物靶相互作用的机制研究，大大提高实验效率。在Discovery Studio该分子模拟综合平台有四种对接程序，包括Libdock、CDOCKER、FlexibleDocking，这三种对接算法各有优势，能够满足科研人员的各种应用需求，为配体受体之间的相互识别提供利器。

通过反向对接筛选triclosan研究新目标

ref：Chemosphere 235 (2019) 976-984；IF=5.108

链接：https://doi.org/10.1016/j.chemosphere.2019.07.027

内分泌干扰物(EDCs)它是一种合成物质，通过多种方式调节内分泌系统的潜力，对人类和野生动物产生广泛的不利影响，三氯生(TCS)化学名称为5-氯-2-(2、4-二氯酚)苯酚，是一种水不溶性物质。TCS在世界上使用了40多年的合成抗菌剂。TCS洗手液、除臭剂、洗发水、化妆品、化妆品、洗衣粉等个人护理产品。也在家用用品和医疗器械中检测到TCS。从各种毒理学数据中可以清楚地看出，TCS对内分泌功能和甲状腺激素的稳态有很强的影响，这是由于TCS它与芳烃和性激素受体有很强的相互作用。因此，它可能被认为是一种潜在的内分泌干扰物。研究有表明TCS对肿瘤的发生起着重要作用毒理学数据也表明TCS它在预防癌症方面起着重要作用。生物学家研究三氯生与所有通路蛋白的相互作用的亲和力评价是一个难点。通过运用DiscoveryStudio中的CDOCKER方法，将TCS寻找226个受体蛋白中的对接TCS最终找到了潜在的目标Receptor-interacting protein 1 (RIP1), Apoptosis signal-regulating，kinase 1 (ASK1) and B-cell lymphoma 2 (Bcl-2)三种受体蛋白和TCS的对接打分分别为-26.88, -23.34，-22.96 kcal/mol。可以作为TCS然后研究靶蛋白TCS引起人体疾病的机制。

图一 TCS的化学结构

 

图二 TCS反向对接的结果

 

图三 TCS与RIP1的结合模式

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